Năm 2199, Trái Đất bị đế chế Gamila từ ngoài vũ trụ xâm lược và phá hoại. Nhân loại chỉ còn một năm trước khi bị tuyệt diệt. Mọi hy vọng giờ đây đổ dồn vào cuộc hành trình vượt 168.000 năm ánh sáng đến hành tinh Iskandar của tàu Yamato, để tìm kiếm công nghệ cứu Trái Đất và kết thúc cuộc chiến.
