Arceus, đấng tạo ra thế giới, đến để phán xét loài người vì tội đánh cắp Jewel of Life (Viên ngọc sự sống). Nhưng Ash Ketchum và những người bạn của cậu đã được gửi ngược thời gian để khám phá và có thể đảo ngược những sự kiện dẫn đến sự trả thù của Arceus.
