Arceus, người sáng tạo ra thế giới, đến để đưa ra phán xét cho nhân loại vì hành vi đánh cắp Viên ngọc sự sống. Nhưng Ash Ketchum và bạn bè của cậu ta đã được gửi trở lại thời gian để khám phá và có thể đảo ngược các sự kiện dẫn đến việc Arceus tự hủy hoại.
