Xã hội Nhật Bản đã bước qua thời kỳ mới, ứng dụng trí thông minh nhân tạo (AI) vào đời sống. Đặc biệt là thế hệ robot AI tên gọi HumaGear do tập đoàn công nghệ AI Hiden Intelligence phát triển. Tuy nhiên, có một tổ chức khủng bố không muốn AI robot phục vụ xã hội loài người tốt hơn nên đã hack vào hệ thống HumaGear, hòng tiêu diệt nhân loại. Tổ chức đó gọi là Metsuboujinrai.net.
Chính phủ Nhật Bản đã thành lập cơ quan đặc biệt chống AI, gọi tắt là A.I.M.S, có nhiệm vụ săn lùng các AI robot HumaGear đã bị hack và duy trì an ninh.
Hiden Aruto, một chàng trai có mơ ước trở thành diễn viên hài, mặc dù nghề này đã bị thay thế bởi AI robot. Một ngày kia, ông nội của Hiden, nhà sáng lập kiêm chủ tịch Hiden Intelligence, qua đời. Aruto được chỉ định làm tân chủ tịch của Hiden Intelligence. Aruto không hứng thú với chức chủ tịch tập đoàn lớn, nhưng tận mắt chứng kiến tình cảnh thảm thương của HumaGear do Metsuboujinrai.net hack nên cậu quyết định nhậm chức và sử dụng Zero-One Driver henshin thành Kamen Rider Zero-One! Aruto chính thức bước vào trận chiến vì các AI robot. Không chỉ chống lại Metsuboujinrai.net mà còn cả A.I.M.S, vốn không mấy thân thiện với AI.
