Câu chuyện bắt đầu với Hundred, loại vũ khí duy nhất có thể chống lại các dạng sống Savage bí ẩn tấn công Trái Đất. Để trở thành một Slayer (bậc thầy của nghệ thuật quân sự), người ta phải sử dụng Hundred này. Nhân vật chính Hayato Kisaragi được đào tạo tại Little Garden. Tuy nhiên... Hayato cảm thấy kỳ lạ khi Emil Crossford, bạn cùng phòng của cậu, bằng cách nào đó đã biết cậu từ lâu. Ngay trong ngày đầu tiên vào trường, anh đã được thử thách bởi một cuộc đấu tay đôi với Claire Harvey, Nữ hoàng (Slayer mạnh nhất của trường)! Và đây là câu chuyện về Hundred...
