Lione kể lại câu chuyện về một cô công chúa đến từ một đất nước nhỏ, nhập học vào một trường ở Hokkaido vào mùa xuân. Trường này có một tổ chức giáo dục chuyên biệt do ALCA điều hành, chuyên đào tạo các nhà Logicallist, những người duy trì hòa bình thế giới. Lione bước vào lớp S, nơi cô gặp nhiều bạn cùng lớp với những tính cách độc đáo, ví dụ như Nina. Và rồi, những câu chuyện cứ thế bắt đầu.
