Những sinh vật bí ẩn biết bay có tên là Xi đột nhiên xuất hiện để đối đầu với loài người. Con người đã tạo ra các chiến đấu cơ Dau ghters và hệ thống chiến đấu tự động Anima có hình dáng như những thiếu nữ. Trung tâm câu chuyện là một anh chàng trẻ tuổi tên Na ru tani Kei với khát khao bay trên bầu trời và một Anima được xem là quân chủ bài của nhân loại, cô gái ấy tên là Gipen.
